A Tudományos Tanács az Egyetem kutatási, fejlesztési és innovációs stratégiájának kialakítását és megvalósítását, az Egyetem tudományos tevékenységét irányító testület.

A Tudományos Tanács tagjait (karonként 2-2 fő) a Karok dékánjai delegálják, a kar tudományos fokozattal rendelkező oktatói-kutatói közül.

A Tudományos Tanács munkájában tanácskozási joggal részt vesz a rektor, a kancellár, a tudományos rektorhelyettes és az oktatási rektorhelyettes. 

A Tudományos Tanács elnökére a tagok tesznek javaslatot a Szenátusnak. Az elnök megbízása két évre, de legfeljebb a tagsági viszony fennállásáig szól.  

A Neumann János Egyetem Tudományos Tanácsa:

Elnök:

• Dr. Johanyák Zsolt Csaba főiskolai tanár, dékánhelyettes (GAMFK)

Tagok:

• Dr. Kovács Lóránt dékán (GAMFK)
• Prof. Dr. Ferencz Árpád dékán (KVK)
• Dr. Pető Judit főiskolai tanár (KVK)
• Prof. Dr. Steklács János dékán (PK)
• Dr. Smuta Attila főiskolai tanár (PK)
• Dr. Túróczi Imre főiskolai tanár (GK)
• Dr. Máté Zoltán főiskolai tanár, dékánhelyettes (GK)

A Tudományos Tanács javaslatot tesz:

• a kutatási-fejlesztési-innovációs stratégia kialakítására, megvalósítására,
• tudományos értékelési szempontok kialakítására,
• a tudományos és publikációs tevékenység eredményességének növelésére, javítására,
• az oktatói pályázatokat véleményező ad hoc bizottság tagjaira és elnökére, a Foglalkoztatási Követelményrendszerben foglaltak szerint.

A Tudományos Tanács véleményt nyilvánít: 

• az intézményfejlesztési tervről, 
• a képzési programról, 
• a kutatási programról, 
• a minőségfejlesztési programról,
• valamint az e pontokban meghatározottak végrehajtásának értékeléséről, 
• a tudományos tevékenységgel kapcsolatos ügyekről, 
• az új (alap-, mester) szakok indítása feltételeinek meglétéről, 
• a BSc, BA, MSc, MA szakindítási előterjesztésekről, 
• képzés megszüntetésének kezdeményezéséről, 
• a Szenátus, vagy a rektor felkérésére bármely egyéb ügyről.

A Tudományos Tanács felügyeli és koordinálja az Egyetem:

• tudományos rendezvényeit, 
• tudományos és publikációs tevékenységét, 
• nemzetközi tudományos együttműködéseit, 
• tudományos műveinek kiadását, 
• kutatási eredményeinek hasznosítását, 
• kutatási támogatásainak támogatási feltételeit.